MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidaminococcus fermentans DSM 20731 chromosome

Total Repeats: 44337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013740	CTG	2	6	258232	258237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047595
5002	NC_013740	GCG	2	6	258245	258250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047595
5003	NC_013740	GAG	2	6	258251	258256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047595
5004	NC_013740	A	6	6	258259	258264	100 %	0 %	0 %	0 %	284047595
5005	NC_013740	A	6	6	258407	258412	100 %	0 %	0 %	0 %	284047595
5006	NC_013740	CAA	2	6	258444	258449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047595
5007	NC_013740	CGA	2	6	258456	258461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047595
5008	NC_013740	TGG	2	6	258470	258475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047595
5009	NC_013740	TCCT	2	8	258480	258487	0 %	50 %	0 %	50 %	284047595
5010	NC_013740	GAA	2	6	258501	258506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047595
5011	NC_013740	GCT	3	9	258513	258521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047595
5012	NC_013740	ACATC	2	10	258546	258555	40 %	20 %	0 %	40 %	284047595
5013	NC_013740	GCG	2	6	258583	258588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047595
5014	NC_013740	ATC	2	6	258607	258612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047595
5015	NC_013740	ACA	2	6	258617	258622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047595
5016	NC_013740	CCA	2	6	258650	258655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047595
5017	NC_013740	GCT	2	6	258711	258716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047595
5018	NC_013740	GAA	2	6	258808	258813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047595
5019	NC_013740	GGC	2	6	258858	258863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047595
5020	NC_013740	CAT	2	6	258864	258869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047595
5021	NC_013740	GAA	2	6	258874	258879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047595
5022	NC_013740	CAG	2	6	258895	258900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047595
5023	NC_013740	AAG	2	6	258904	258909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047595
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5025	NC_013740	TCT	2	6	258955	258960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047595
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5027	NC_013740	TGG	2	6	259018	259023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047595
5028	NC_013740	AAGG	2	8	259030	259037	50 %	0 %	50 %	0 %	284047595
5029	NC_013740	GGC	2	6	259041	259046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047595
5030	NC_013740	GAT	2	6	259078	259083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047595
5031	NC_013740	CTG	2	6	259123	259128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047595
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5033	NC_013740	A	6	6	259335	259340	100 %	0 %	0 %	0 %	284047596
5034	NC_013740	GCT	2	6	259397	259402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047596
5035	NC_013740	TGC	2	6	259414	259419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047596
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5037	NC_013740	GCA	2	6	259482	259487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047596
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5039	NC_013740	TGC	2	6	259552	259557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047596
5040	NC_013740	CTGGC	2	10	259581	259590	0 %	20 %	40 %	40 %	284047596
5041	NC_013740	CGGA	2	8	259599	259606	25 %	0 %	50 %	25 %	284047596
5042	NC_013740	TGG	2	6	259639	259644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047596
5043	NC_013740	TCCC	2	8	259657	259664	0 %	25 %	0 %	75 %	284047596
5044	NC_013740	GCT	2	6	259691	259696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047596
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5047	NC_013740	TATTC	2	10	259804	259813	20 %	60 %	0 %	20 %	284047596
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5051	NC_013740	CGGATC	2	12	259976	259987	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284047596
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5053	NC_013740	CCA	2	6	260095	260100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047596
5054	NC_013740	GCT	2	6	260135	260140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047596
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5061	NC_013740	CGGTA	2	10	260447	260456	20 %	20 %	40 %	20 %	284047596
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5102	NC_013740	ACAG	2	8	262274	262281	50 %	0 %	25 %	25 %	284047598
5103	NC_013740	GAA	2	6	262446	262451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047598
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5107	NC_013740	CTC	2	6	262504	262509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047598
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5110	NC_013740	GCCCG	2	10	262571	262580	0 %	0 %	40 %	60 %	284047598
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5112	NC_013740	TGG	2	6	262619	262624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047598
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5119	NC_013740	GTCCG	2	10	263019	263028	0 %	20 %	40 %	40 %	284047599
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5121	NC_013740	CAG	2	6	263078	263083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047599
5122	NC_013740	CCA	2	6	263296	263301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047599
5123	NC_013740	GTA	2	6	263321	263326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047599
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5125	NC_013740	CTG	2	6	263363	263368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047599
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5151	NC_013740	TG	3	6	264741	264746	0 %	50 %	50 %	0 %	284047601
5152	NC_013740	GGT	2	6	264821	264826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047601
5153	NC_013740	GGC	3	9	264827	264835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047601
5154	NC_013740	CTG	2	6	264897	264902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047601
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5229	NC_013740	CCG	2	6	268595	268600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047605
5230	NC_013740	ATCT	2	8	268610	268617	25 %	50 %	0 %	25 %	284047605
5231	NC_013740	GCT	2	6	268639	268644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047605
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5233	NC_013740	TC	3	6	268763	268768	0 %	50 %	0 %	50 %	284047605
5234	NC_013740	CCA	2	6	268791	268796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047605
5235	NC_013740	GAA	2	6	268820	268825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047605
5236	NC_013740	GGC	2	6	268871	268876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047605
5237	NC_013740	ATGCC	2	10	268896	268905	20 %	20 %	20 %	40 %	284047605
5238	NC_013740	TGG	2	6	268926	268931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047605
5239	NC_013740	GAA	3	9	268951	268959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047605
5240	NC_013740	A	6	6	268974	268979	100 %	0 %	0 %	0 %	284047606
5241	NC_013740	ACC	2	6	269033	269038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047606
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5243	NC_013740	TGC	2	6	269055	269060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047606
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5360	NC_013740	GGAA	2	8	276366	276373	50 %	0 %	50 %	0 %	284047612
5361	NC_013740	GTC	2	6	276385	276390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047612
5362	NC_013740	CGGGGC	2	12	276391	276402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047612
5363	NC_013740	GCC	2	6	276467	276472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047612
5364	NC_013740	GGT	2	6	276529	276534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047612
5365	NC_013740	TGC	2	6	276543	276548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047612
5366	NC_013740	G	6	6	276621	276626	0 %	0 %	100 %	0 %	284047612
5367	NC_013740	CAT	2	6	276634	276639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047612
5368	NC_013740	ATG	2	6	276648	276653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047612
5369	NC_013740	TGG	2	6	276654	276659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047612
5370	NC_013740	CGA	2	6	276664	276669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047612
5371	NC_013740	GACAAC	2	12	276683	276694	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	284047612
5372	NC_013740	TGG	2	6	276705	276710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047612
5373	NC_013740	GCGGAT	2	12	276719	276730	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	284047612
5374	NC_013740	CTG	2	6	276740	276745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047612
5375	NC_013740	GTG	2	6	276809	276814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047612
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5378	NC_013740	TCC	2	6	276963	276968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047612
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5380	NC_013740	GCA	2	6	277125	277130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047612
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5382	NC_013740	GACCTG	2	12	277247	277258	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284047612
5383	NC_013740	CCAG	2	8	277275	277282	25 %	0 %	25 %	50 %	284047612
5384	NC_013740	GAA	2	6	277286	277291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047612
5385	NC_013740	A	6	6	277290	277295	100 %	0 %	0 %	0 %	284047612
5386	NC_013740	TGG	2	6	277338	277343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047612
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5388	NC_013740	GCT	2	6	277481	277486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047613
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5390	NC_013740	A	7	7	277495	277501	100 %	0 %	0 %	0 %	284047613
5391	NC_013740	GAA	2	6	277530	277535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047613
5392	NC_013740	AGGG	2	8	277543	277550	25 %	0 %	75 %	0 %	284047613
5393	NC_013740	CCT	2	6	277562	277567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047613
5394	NC_013740	GCT	3	9	277574	277582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047613
5395	NC_013740	ATC	2	6	277728	277733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047613
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5399	NC_013740	TGG	2	6	277957	277962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047613
5400	NC_013740	CGGGG	2	10	277977	277986	0 %	0 %	80 %	20 %	284047613
5401	NC_013740	GT	3	6	278049	278054	0 %	50 %	50 %	0 %	284047613
5402	NC_013740	CTG	2	6	278154	278159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047613
5403	NC_013740	GTG	2	6	278331	278336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047613
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5419	NC_013740	GAT	2	6	279097	279102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047614
5420	NC_013740	GCGG	2	8	279132	279139	0 %	0 %	75 %	25 %	284047614
5421	NC_013740	TGG	2	6	279143	279148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047614
5422	NC_013740	CTG	2	6	279181	279186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047614
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5426	NC_013740	CCA	4	12	279536	279547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047614
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5429	NC_013740	CTG	2	6	279601	279606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047614
5430	NC_013740	CCA	2	6	279608	279613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047614
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5432	NC_013740	CTG	2	6	279760	279765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047614
5433	NC_013740	TGG	2	6	279818	279823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047614
5434	NC_013740	GCA	2	6	279845	279850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047614
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5440	NC_013740	CTG	2	6	280184	280189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047615
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5455	NC_013740	GCA	2	6	280756	280761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047616
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5462	NC_013740	CAGGAT	2	12	281181	281192	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284047616
5463	NC_013740	GAT	2	6	281355	281360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047616
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5465	NC_013740	ATC	2	6	281388	281393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047616
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5481	NC_013740	GCG	2	6	281763	281768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047616
5482	NC_013740	CTG	2	6	281769	281774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047616
5483	NC_013740	TCC	2	6	281852	281857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047617
5484	NC_013740	CTG	2	6	281914	281919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047617
5485	NC_013740	GTG	2	6	281941	281946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047617
5486	NC_013740	CCA	2	6	282026	282031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047618
5487	NC_013740	CTTC	2	8	282076	282083	0 %	50 %	0 %	50 %	284047618
5488	NC_013740	CCG	2	6	282180	282185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047618
5489	NC_013740	GGA	2	6	282197	282202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047618
5490	NC_013740	AAG	2	6	282308	282313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047618
5491	NC_013740	GAT	2	6	282393	282398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047618
5492	NC_013740	GCA	2	6	282413	282418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047618
5493	NC_013740	TC	3	6	282475	282480	0 %	50 %	0 %	50 %	284047618
5494	NC_013740	GGA	2	6	282499	282504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047618
5495	NC_013740	GTG	3	9	282520	282528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047618
5496	NC_013740	GGT	2	6	282543	282548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047618
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5498	NC_013740	TGA	2	6	282860	282865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047619
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